项目评估委员会同意对该项目继续予以资助，并认为项目在第二个执行年内取得了如下重要成果和社会影响力：

2024年4月至2025年3月，项目团队使用第一年研发出的非损伤性的夜间直接调查法，开展了大量扎实细致的野外调查工作，沿陇县的蒲峪河和洋县的酉水河设置不同海拔的样地和样点，全年共测量到1300多尾秦岭细鳞鲑的体长和年龄，掌握了在春夏秋冬四个不同季节内两条河中该物种的分布、种群密度、年龄结构和季节性变化，揭示出冬季该物种向低海拔越冬洄游的特征。项目还通过测量栖息地的生物与非生物指标，评估发现两个保护区的栖息地环境较为稳定，但也存在水坝、公路、生活垃圾、农田、修整河堤、放牧等人为干扰。

本期项目最大的亮点是在野外对该物种开展了创新性的围栏试验和水下摄像，通过构建4个仿生态人工繁育系统和50余个野外胚胎孵化系统，在国内首次成功观测和记录了3对秦岭细鳞鲑的繁殖行为，并掌握了不同环境化学信息、植物分泌物以及亲本信息对秦岭细鳞鲑胚胎发育的影响。项目揭示了砂石底质为理想的产卵基质，而高捕食压力会造成胚胎发育形态显著异常、畸形率显著增高。这些繁殖生态学的研究结果，为之后系统性地开展产卵场保护、栖息地修复以及生活史早期生态适应等相关研究奠定了扎实的基础。此外，项目团队还通过开展培训、发表学术论文、参加学术会议、向地方政府提交咨政报告，提升了秦岭细鳞鲑保护网络成员的能力，提高了政府部门和学术领域对该物种关注度。

在第三个执行年里，项目团队将沿陇县的蒲峪河和洋县的酉水河，持续开展种群密度、分布、体长和年龄的四季监测，并综合三年的本底和监测数据，分析两条河流内该物种的分布模式、洄游特征、年龄结构和种群动态变化。项目还将重点针对秦岭细鳞鲑小微尺度栖息地的环境特征开展实地调研，以便为后期开展栖息地的适宜性评估和生态修复提供科学依据。在繁殖行为和繁殖生态学方面，项目还将继续在野外开展围栏试验和水下摄影，以期揭示秦岭细鳞鲑的繁殖行为谱及胚胎和早期仔稚鱼对温度、水流等关键生态因子的适应性。最后，项目将基于三年的成果，构建基于科学的秦岭细鳞鲑自然种群监测技术体系，并在“秦岭细鳞鲑保护网络成员”中进行推广、培训和运用。